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医学影像学、麻醉学、医学检验专业是省级重点专业,医学影像学专业是省级一类特色专业和国家级一类特色建设专业。人体解剖学、组织胚胎学、生物遗传学、病原生物学、影像设备学、诊断学是省级精品课程,内科学、机能学实验是省高校教学团队。人体解剖与组织胚胎学、病理学与病理生理学、药理学是省级重点学科。
牡丹江医学院由1946年始建的牡丹江专区医院、1952年始建的黑龙江省卫生干部进修学校于1958年共同创建,是黑龙江省东南部地区唯一一所省属普通本科医药院校,著名历史学家郭沫若先生题写了校名。
1997年一次性通过教育部本科教学合格评价。2006年在教育部本科教学水平评估中,专家组给予了优秀评价,全国评价为良好。2010年被列为黑龙江省特色应用型本科高校建设单位。2012年被评为全国首批卓越医生教育培训计划项目试点高校。2013年获得硕士学位授予权。2015年,被授予“全国文明单位”称号,在教育部临床医学专业认证中获得了6年有效期,居地方医学院校领先水平。2016年,在国家本科教学审核评估中获得专家组高度评价。
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