菏泽医学专科学校现有大学路、康复路、雷泽湖三个校区，占地面积1200亩；校舍建筑总面积34.52万平米，其中教学行政用房21.4万平米；教学科研仪器设备总值12753.15万元；图书馆纸质图书88.43万册；已建成现代智慧校园，实现有线和无线网络无缝隙全覆盖，行政、教学、招生、学生、人事、财务、后勤、图书等服务与管理实现互联互通、资源共享和办公自动化。建设有功能强大的信息化教学平台和较为完善的信息化教学资源库，并与校园网络系统对接，创建了“处处能学，随时可学”的信息化学习平台。目前全日制在校生11600人。
菏泽医学专科学校成立由学校领导和有关部门负责人组成的招生工作领导小组，负责学校招生工作。菏泽医学专科学校招生办公室是组织和实施招生及其相关工作的常设机构，具体负责菏泽医学专科学校普通高等教育专科招生的日常工作；执行教育部和省招生委员会有关招生工作的规定和实施意见，以及主管部门和有关省级招生委员会的补充规定或实施细则；根据国家和省政府核准下达的年度招生计划规模及有关规定编制并报送本校分省分专业招生计划；制订并向社会公布本校招生章程；实事求是地开展招生宣传工作；组织实施本校录取工作，负责协调和处理本校录取工作中的有关问题；对录取的新生进行复查；接受教育行政部门委托组织本校有关单独招生考试工作；支持有关招生管理部门完成招生方面的其它工作。
菏泽医学专科学校招生计划通过各省招生主管部门、学校招生简章、学校网站等渠道向考生公布。在高考成绩达到同批次录取最低控制分数线的考生中，学校按照各省教育招生考试院规定的投档比例调阅考生档案，具体比例由各省（市）招生主管部门确定。
按教育部要求，实行“学校负责，招办监督”的录取体制，贯彻执行德智体全面衡量，以文化成绩为主，公平竞争、择优录取的原则。
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