合肥轨道交通学校的前身是“合肥商务科技职业学校（原农垦职工中专学校）”，1984年经安徽省人民政府批准创办的一所公办、正县级单位。2008年底移交长丰县人民政府，隶属县教体局管理。
学校位于长丰县县城水湖镇，区位优势明显，校园环境优美。学校占地面积134亩，建筑面积近3万平米。教学、生活设施设备齐全配套，有田径场、足球场、篮球场和学生公寓及餐厅、浴室等。已建成数字化校园，拥有微机室、电工电子实验室和实训室、电子商务实验室和实训室、计算机网络综合布线实训室以及数控实验室、音乐室、舞蹈室、美术室、语音室、录播室、图书室和电子阅览室以及稳定的校外实训、实习基地等。学校师资力量雄厚，开设了计算机及其应用、电子技术应用、电子商务等专业。为顺应轨道交通迅速发展的需要，更好地服务于区域经济社会的发展，2017年起与南昌向远轨道技术学校开展专业共建、合作办学，增设了铁道运输管理、城市轨道交通运营管理、电气化铁道供电、铁道车辆运用与检修、城市轨道交通车辆运用与维修等社会热门专业。
学校秉承“为学生的发展奠基”的办学理念，按照专业要求、参照行业标准实施严格精细管理，实现学生升学有希望、就业有保障、创业有本领，致力打造长丰模式，办出合肥特色，成就出彩人生。建校三十多年来，为社会培养了大量的技术技能型人才，赢得了社会的普遍赞誉。学校先后被教育部、省教育厅授予“成人教育办学先进单位”“成人教育先进学校”荣誉，多次被县教体局授予中等职业学校“教育工作先进单位”、“招生先进单位”、“毕业生就业工作先进单位”、“安全稳定先进单位”、“学生资助先进单位”等荣誉称号。
南昌向远轨道技术学校是以铁路运输和轨道交通专业为主的全日制中等专业学校，在籍5000余人，教职工260余人，学校一校两区，占地面积共200余亩。现开设铁路运输管理、电气化铁道供电、铁道机车车辆、铁道信号、航空服务等专业，是目前江西省规模最大的一所专注铁路轨道交通专业的学校。
为顺应安徽铁路轨道交通的高速发展，满足社会对铁路轨道交通专业人才的需求，经合肥市教育局备案合肥商务科技职业学校与南昌向远轨道技术学校合作办学，共建铁路轨道交通相关专业。
