甘南藏族自治州卫生学校于1977年开始着手筹建工作,于1979年完成,同年十月举行了开学典礼。学校坐落于甘南藏族自治州首府所在地合作市,占地面积23333㎡,其中教学楼1519㎡,实验楼1382㎡,电教楼637㎡,其他教学附属建筑10598㎡,学生规模从最初的200人发展到今天的600人,专业设置也扩大为社区医学、藏医士、妇幼卫生、检验、成人中专等六个专业。
截止2001年底,有教职工109人,其中专业人员79人;专业人员中有专任及聘请教师76人,其中高级讲师14人,中级23人;本科学历19人,大专学历39人;职工组成中本州人员88%,藏族54%,目前教职工队伍呈现出稳定发展的局面。学校为正县级中等医学教学单位,下设办公室、教务科、总务科、分别管理着五个教研组、十个实验室和相关的教学辅助部门。群众组织健全,教学管理有序,各级部门协调有序地保证着教学工作的顺利开展。
在师资建设方面,经过多年吸收、引进、进修、自学、提高等多种形式,使学校教师的整体学历水平逐渐得到提高,师资学历、年龄、职称等结构趋于合理,76名专职和聘请教师中,高、中级专业教师达37人,占专职教师的48.7%。同时,学校教师队伍不仅具有较强的教学能力,还有很大一部分教师的学术水平也在教学实践中不断提高,在国内外专业杂志报刊上发表了近百篇论文,有些教师还出版了专著或在国际学术会上获奖。